БИОХИМИЯ, БИОТЕХНОЛОГИЯ И ДИАГНОСТИКА
Научная статья
УДК 619:576.895.1
Метод времяпролетной масс-спектрометрии с лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF) для исследования белкового профиля гельминтов промысловых рыб
Аввакумова Ольга Вячеславовна 1, Скоморина Юлия Александровна 2
1, 2 Всероссийский научно-исследовательский институт фундаментальной и прикладной паразитологии животных и растений – филиал Федерального государственного бюджетного научного учреждения «Федеральный научный центр – Всероссийский научно-исследовательский институт экспериментальной ветеринарии имени К. И. Скрябина и Я. Р. Коваленко Российской академии наук» (ВНИИП – фил. ФГБНУ ФНЦ ВИЭВ РАН), Москва, Россия
2 Федеральный центр охраны здоровья животных (ФГБУ «ВНИИЗЖ»), Владимир, Россия
2 Федеральный центр охраны здоровья животных (ФГБУ «ВНИИЗЖ»), Владимир, Россия
Аннотация
Цель исследований – отработать метод пробоподготовки, используя расходные материалы (лизис-буферы) российского производства, для изучения белкового профиля санитарно-значимых гельминтов промысловых рыб методом времяпролетной масс-спектрометрии с лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF).
Материалы и методы. Для работы были отобраны 98 экз. гельминтов от трех видов рыб: половозрелые цестоды Triaenophorus nodulosus из кишечника щуки (Esox lucius), плероцеркоиды (личинки) цестод Diphyllobothrium ditremum из стенки желудка и кишечника ряпушки европейской (Coregonus albula), личинки нематод Eustrongylides excisus из мышечной ткани и печени окуня обыкновенного (Perca fluviatilis). Ихтиологический материал был получен с помощью пассивных орудий лова (сети) в период с января по август 2025 года и доставлен в лабораторию в замороженном виде. В лабораторных условиях проводили вскрытие рыб, осмотр мышечной ткани и внутренних органов под бинокулярным микроскопом Motic SMZ-171T. Для видовой идентификации паразитов использовали определители паразитов пресноводных рыб фауны СССР Гусева (1985) и Авдеева (1987). Фотодокументацию выполняли на микроскопе Zeiss AxioImager Z.1. Пробоподготовку (экстракцию) гельминтов проводили согласно патенту N RU 2768162 C1 «Способ подготовки половозрелых особей нематод для идентификации методом MALDI TOF масс-спектрометрии» (2022). Масс-спектрометрию гельминтов выполняли на масс-спектрометре MALDI (Microflex, Bruker Germany).
Результаты и обсуждение. На сегодняшний день в Российской Федерации имеется необходимость в разработке, верификации и внедрении в практическую деятельность испытательных лабораторий рабочих протоколов метода MALDI-TOF MS для диагностики инвазий рыб, используемых для пищевых целей, и создания единой референсбиблиотеки спектров белков гельминтов, встречающихся на территории России. Однако, метод пробоподготовки (экстракции) гельминтов не отработан и не разработан стандартный операционный протокол для проведения диагностического исследования гельминтов методом времяпролетной масс-спектрометрии. Нами предприняты исследования по отработке метода пробоподготовки (экстракции) гельминтов с использованием расходных материалов и реактивов российского производства. В результате проведенных нами исследований был отработан протокол пробоподготовки и получен 41 масс-спектр.
Ключевые слова: протеомный анализ, масс-спектрометрия, MALDI-TOF масс-спектрометрия, паразиты, гельминты, нематоды, цестоды
Благодарности. Работа по видовой идентификации паразитов выполнена при финансовой поддержке Минобрнауки РФ в рамках государственного задания № FGUG-2025-0008 без привлечения дополнительных источников финансирования.
Конфликт интересов. Авторы заявляют об отсутствии конфликта интересов.
Для цитирования: Аввакумова О. В., Скоморина Ю. А. Метод времяпролетной масс-спектрометрии с лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF) для исследования белкового профиля гельминтов промысловых рыб // Российский паразитологический журнал. 2025. Т. 19. № 4. С. 471–479.
© Аввакумова О. В., Скоморина Ю. А., 2025